Индукция и репрессия синтеза ферментов
Клетки могут синтезировать специфические ферменты в ответ на присутствие специфических низкомолекулярных индукторов.
Ферменты, концентрация которых в клетке не зависит от добавления индукторов, называются конститутивными.
Обычно клетки содержат небольшое, но измеримое количество соответствующего фермента даже в отсутствие индуктора. Это – базовый уровень. Величина отклика данного организма на введение индуктора определяется генетически.
При индукции может наблюдаться повышение содержания фермента, варьирующее от двукратного до тысячекратного. Таким образом, содержащаяся
в клетке наследственная генетическая информация определяет и характер, и величину реакции на введение индуктора.
Примерами индуцируемых ферментов у млекопитающих являются триптофанпирролаза, треониндегидраза, тирозин-α-оксоглутарат-трансаминаза, инвертаза, ферменты цикла мочевины, HMG-СоА-редуктаза и цитохром Р-450.
| Некоторые ферменты, для действия которых необходимы в качестве кофакторов ионы и атомы металлов: |
|
| Коферменты, выполняющие роль промежуточных переносчиков некоторых атомов или функциональных групп: |
|
Принципы регуляции метаболических путей
Регуляция каталитической активности фермента– отрицательная обратная связь:
Регуляция каталитической активности ферментов путём фосфорилирования/дефосфорилирования:
| Ковалентная модификация, регулирующая работу фермента и осуществляемая путем фосфорилирования/дефосфорилирования остатка серина |
|
Регуляция каталитической активности ферментов частичным (ограниченным) протеолизом:

| Ингибирование по принципу обратной связи на различных участках разветвленного биосинтетического пути. |
|
S1-S5 – промежуточные соединения, образующиеся в ходе биосинтеза конечных продуктов A-D. Прямые стрелки соответствуют ферментам, катализирующим указанные превращения. Кривыми стрелками указаны петли обратной связи и вероятные участки ингибирования по принципу обратной связи специфическими конечными продуктами.
Некоторые ферменты млекопитающих, каталитическая активность которых в фосфорилированном и дефосфорилированном состояниях различна (Е – дефосфофермент, ЕР – фосфофермент):

| 1. Оксидоредуктазы | Перенос электронов и протонов |
| 2. Трансферазы | Перенос групп атомов, отличных от атомов водорода |
| 3. Гидролазы | Гидролиз различных связей (с участием молекулы воды) |
| 4. Лиазы | Образование двойных связей за счет удаления групп или добавление групп за счет разрыва двойных связей |
| 5. Изомеразы | Внутримолекулярный перенос групп с образованием изомерных форм |
| 6. Лигазы (синтетазы) | Соединение двух молекул и образование связей С—С, С—О, С—S и С—N, сопряженных с разрывом пирофосфатной связи АТФ |
Оксидоредуктазы
Дегидрогеназы

Трансферазы

Гидролазы

Лиазы

Изомеразы

Когда изомеризация состоит из внутримолекулярном переносе группы, фермент называют «мутазой»:

Лигазы (синтетазы)

В случае, когда источником энергии служит любое другое макроэргическое соединение (не АТФ), ферменты называют синтазами

Физически различимые формы ферментов, обладающие одним и тем же видом каталитической активности, могут присутствовать в разных тканях одного организма, в разных типах клеток одной ткани и даже в прокариотическом организме, например в Е. coli.
Термин «изофермент» («изозим») охватывает все вышеупомянутые физически различимые белки с данной каталитической активностью, однако на практике, и особенно в клинической медицине, его употребляют в более узком смысле, подразумевая физически различимые и поддающиеся разделению формы данного фермента, присутствующие в различных типах клеток данного эукариотического организма, например человека. Известны изоферментные формы дегидрогеназ, оксидаз, трансаминаз, фосфатаз, трансфосфорилаз и протеолитических ферментов. В различных тканях могут находиться разные изоферменты, и эти изоферменты могут иметь неодинаковое сродство к субстратам.
Органоспецифичность
В процессе дифференцировки клеток происходит изменение ферментного состава клеток. Так, фермент аргиназа (участвует в синтезе мочевины) находится только в клетках печени, кислая фосфатаза (участвует в гидролизе моноэфиров ортофосфорной кислоты) – в клетках простаты.