Долгота и краткость слога и определение места ударения
Ударение в латинских словах падает или на предпоследний слог, или (в трехсложных и многосложных словах) на третий слог от конца слова, в двусложных словах – всегда на первый слог: Lrus — чайка, mscus — мох, stgma — рыльце.
В словах, состоящих из трех и более слогов, ударение определяется по долготе или краткости второго слога от конца слова. Долгота слова условно обозначается чертой (ā), краткость — дужкой (ă), эти знаки проставляются в учебной литературе над вторым гласным от конца слова: canlis — канал, orgo — происхождение, Pterpŏda — крылоногие, sclĕton — скелет.
Второй слог от конца слова может быть долгим и кратким или изначально (по своей природе), или по положению, или по составу. Если этот слог долгий, на него падает ударение: formen — отверстие, spermothca — спермотека, Trichomyctes — трихомецеты. Если он краткий, ударение падает на третий слог от конца слова: dgĭtus — палец, Insectvŏra — насекомоядные, psychrphўton — психрофит, ramcŏla — обитающий на ветвях.
Определить изначальную долготу и краткость второго слога от конца слова можно по некоторым стандартным и часто повторяющимся морфологическим элементам слов. К ним прежде всего относятся суффиксы, содержащие долгий или краткий гласный.
Наиболее частотные долгие суффиксы:
| -āl | frontālis — лобный Taxāles — тисовые unisexuālis — однополый | 
| -ār | articulāris — суставной musculāris — мышечный vulgāris — обыкновенный | 
| -ān | humānus — человеческий montānus — горный urbānus — городской | 
| -āt | collucātus — осветленный pennātus — оперившийся sceletizātus — скелетированный | 
| -īd | Ciconīdae — аистовые Hydrophilīdae — водолюбы Silphīdae — мертвоеды (о случаях краткости суффикса -id- см. §57) | 
| -īn | alpīnus — альпийский marīnus — морской ursīnus — медвежий | 
| -ōs | cetodōsis — цетодоз petrōsus — каменистый symbiōsis — симбиоз | 
| -ūr | junctūra — соединение matūrus — зрелый natūra — природа | 
Краткие суффиксы:
| -ĭc | microscopĭcus — микроскопический organĭcus — органический phototrophĭcus — фототрофический | 
| -ŏl | alveŏlus — альвеола bronchiŏlus — бронхиола vacuŏla — вакуоль | 
| -ŭl | gastrŭla — гаструла receptacŭlum — цветоложе venticŭlus — желудочек | 
Кроме суффиксов к стабильным в отношении графики и семантики морфологическим частотным элементам в биологической терминологии принадлежат конечные двух- и (реже) трехсложные словообразовательные элементы, восходящие чаще всего к греческим существительным и прилагательным, а иногда и к латинским глаголам. Предпоследний слог этих словообразовательных элементов иногда бывает долгим, но в большинстве случаев он краток.
К первой группе можно отнести три словообразовательных элемента:
| -cīda (-cīdum) | herbicīda — гербициды insecticīdum — исектицид | 
| -sōma | Calosōma — красотел (насекомое) chromosōma — хромосома lysosōma — лизосома | 
| -thēca | hydrothēca — гидротека spermothēca — спермотека sporothēca — споротека | 
Частотные словообразовательные элементы с кратким предпоследним слогом:
| -cephălus (-cephăla, -cephălum) | brachycephălus — брахицефал leucocephălus — белоголовый Rhinocephăla — корнеголовые (моллюски) | 
| -cŏla | arenicŏla — обитающий в песке saxicŏla — обитающий на скалах | 
| -cўtus | erythrocўtus — эритросит nephrophagocўtus — нефрофагоцит trichocўtus — трихоцит | 
| -dactўlus (-dactўla, dactўlum) | adactўlus — беспалый bidactўlus — двупалый tetradactўlus — четырехпалый | 
| -gămus (-găma, -gămum) | heterogămus — гетерогамный isogămus — изогамный polygămus — полигамный | 
| -genĕsis | anthropogenĕsis — антропогенез biogenĕsis — биогенез phylogenĕsis — филогенез | 
| -gĕnus (-gĕna, -gĕnum) | anthropogĕnum — антропоген antigĕna — антигены homogĕnus — гомогенный | 
| -petălus (-petăla, -petălum) | choripetălus — хорипетальный polypetălus — многолепестковый tetrapetălus — четырехлистный | 
| -phăgus (-phăga, -phăgum) | bacteriophăgus — бактериофаг fructiphăgus — плодоядный polyphăgus — полифаг | 
| -phĭlus (-phĭla, -phĭlum) | hydrophĭlus — гидрофильный potamophĭlus — реколюбивый thermophĭlus — теплолюбивый | 
| -phŏbus (-phŏba, -phŏbum) | aёrophŏbus — аэрофобный hydrophŏbus — гидрофобный photophŏbus — фотофобный | 
| -phŏrus (-phŏra, -phŏrum) | carpophŏrum — карпофор chromatophŏrum — хроматофор Pogonophŏra — погонофоры (моллюски) | 
| -phўta (-phўton) | geophўton — геофит hydrophўton — гидрофит Chlorophўta — зеленые водоросли | 
| -pŏda (-pŏdus) | Arthropŏda — членистоногие Gastropŏda — брюхоногоие macropŏdus — длинноножковый | 
| -ptĕra (-ptĕrus, -ptĕryx) | Heteroptĕra — разнокрылые tetraptĕrus — четырехкрылый Saccoptĕryx — мешкокрыл | 
| -spŏra | heterospŏra — гетероспора microspŏra — микроспора polyspŏra — полиспора | 
| -tўpus | genotўpus — генотип isotўpus — изотип prototўpus — прототип | 
| -vŏrus (-vŏra, -vŏrum) | Carnivŏra — хищники herbivŏrus — травоядный insectivŏrus — насекомоядный | 
При произношении терминов с обозначенными выше суффиксами и конечными словообразовательными элементами, содержащими предпоследний гласный, краткий по природе, следует быть особенно внимательным, чтобы не допускать ошибок в постановке ударения, которые могут быть обусловлены ударением в русских терминах, ср.:
| рус.: | альвела карпофр филогенз генотп эритроцт | лат.: | alvŏlus carpphŏrum philognĕsis gentўpus erythrcўtus | 
По своему расположению или составу слог бывает долгим в следующих случаях:
1) если гласный находится перед двумя или более согласными: Angiospermae — покрытосеменные, camprestris — полевой, cryptocarpus — скрытоплодный, maxilla — верхняя челюсть.
Однако перед сочетанием одной из так называемых немых (b, c, d, g, p, t) с плавной (l или r) гласный может оставаться кратким или быть долгим в зависимости от изначальной краткости или долготы: cerĕbrum — головной мозг, Ephĕdra — эфедра, но: cicātrix — рубец, salūbris — целебная;
2) гласный находится перед согласными x и z: reflexus — рефлекс, Glycyrrhiza — солодка-лакричник;
3) в состав слога входит дифтонг: centrosphaera — центросфера, oligocoenum — олигоцен.
Слог по положению его гласной бывает кратким:
1) если гласная находится перед гласной: Pinnipedia — ластоногие, subspecies — подвид.
Однако иногда, главным образом в словах греческого происхождения, ударение сохраняется на предпоследнем слоге, так как в греческом слове в данном слоге был дифтонг или долгий гласный: hyperborēus — северный, peritonēum — брюшина, Protozōa — животные простейшие, stomodēum — стомодеум, trachēa — трахея;
2) гласная находится перед сочетаниями ch, ph, rh, th или входит в состав сочетания с группой qu: monostĭchus — однорядный, Elĕphas — слон, Agnătha — бесчелюстные, semiliquĭdus — полужидкий.
Упражнения
1. Определите место ударения, ориентируясь на долготу или краткость второго слога от конца слова:
anophĕles maculipennis — малярийный комар; Aquĭla chrisaĕtos — беркут; Ascăris lubricoideus — аскарида человеческая; Athēne noctua — сыч домовой; Blatella germanĭca — таракан рыжий; Dendrocŏpos leucoptĕrus — дятел белокрылый; Gyromitra esculenta — строчок обыкновенный; Equisētum arvense — хвощ полевой; Hirūdo medicinālis — пиявка медицинская; Inonōtus obliquus — чага, березовый гриб; Lacerta brevicauda — ящерица короткохвостая; Lagostrŏphus fasciātus — кенгуру полосатый; Leonūrus quinquelobātus — пустырник пятилопастный; Leptinotarsa decemlineāta — колорадский (картофельный) жук; Locusta migratoria — саранча перелетная; Loxodonta africāna — слон африканский; Medicāgo falcāta — люцерна серповидная; nucleus spermatogĕnus — ядро сперматогенное; peduncŭlus fructĭfer — плодоножка; radīces caulogĕnae — корни стеблеродные; Salvia nemorōsa — шалфей дубравный; sporangium multicellulāre — спорангий многоклеточный; Vaccinium myrtillus — черника; Viŏla tricŏlor — фиалка трехцветная.
2. Определите изначальную долготу или краткость предпоследней гласной, входящей в состав частотных суффиксов или словообразовательных элементов:
acipenser stellatus — севрюга; Arachnida — паукообразные; Bucephala clangula — гоголь; Cyprinus carpio — карп; facies maxillaris — верхнечелюстная поверхность; foveolae granulares — зернистые ямочки; funiculus medullae oblongatae — канатик спинного мозга; Microchiroptera — летучие мыши; Malacosoma neustria — коконопряд кольчатый; Mallophaga — пухоеды; macrogametocytus — макрогометоцит; morphogenesis — морфогенез; mutagena — мутагены; hydrophyta — водные растения; plantae mirmicophilae — растения, на которых поселяются муравьи; Rhinchophorus — пальмовый долгоносик; sclerodermaticus — толстокожий; Ursus americanus — американский медведь; zoospora pathogena — патогенная зооспора.