Четырехфакторный иерархический дисперсионный анализ 2 страница
Матрица разностей групповых средних по фактору В
НСР05= |
20. Общие выводы по дисперсионному анализу:
____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
Работа сдана «_______» ______________________ 20______ г.
Оценка работы __________________________________
Преподаватель ___________________________ ( )
РАЗДЕЛ №4. Таксономический анализ (10 часов)
Практическое занятие №9. Невесовая таксономия: нумерическая таксономия Сокела и Снита(4 часа)
1. Матрица исходных данных, унифицированных в оцифрованную (0/1) номинальную шкалу (30 сеянцев алычи, 10 признаков, табл.1)
2. Вычисляем коэффициенты сходства по Сокелу и Сниту каждого сеянца с каждым по формуле (табл.2):
где: ks – коэффициент сходства;
m – число признаков, у которых модальности одинаковые;
n – общее число признаков (n=10)
Коэффициенты сходства сеянца с собой по определению равны 1,0 и не вычисляются (расположены по диагонали матрицы).
3. Проводим максимальный корреляционный путь по Выханду (практическое занятие №4, табл.3)
4. Строим дендрит максимальных коэффициентов сходства 30 сеянцев алычи по комплексу 10 признаков (рис. 1).
5. Разрезаем дендрит на кластеры, разрывая относительно слабые связи менее 0,7. В результате чего возникает 21 кластер (рис.2)
6. Оцениваем корректность выделения 21 кластера путем вычисления средних внутрикластерных и межкластерных коэффициентов сходства и составления из них матрицы (табл.4).
Пример вычисления внутрикластерного коэффициента сходства (на примере кластера №5 из четырех объектов – 4, 8, 15 и 26):
Средний внутрикластерный коэффициент сходства между объектами кластера №5
Сумма | Среднее | |||||
0,7 | 0,6 | 0,7 | 2,0 | 0,65 | ||
0,6 | 0,6 | 1,2 | ||||
0,7 | 0,7 |
Пример вычисления межкластерного коэффициента сходства (на примере кластеров 1 и5):
Средний коэффициент сходства между кластерами 1 и 5
Кластер 5 | Сумма | Среднее | |||||
Кластер 1 | 0,2 | 0,4 | 0,5 | 0,5 | 1,6 | 0,39 | |
0,3 | 0,2 | 0,5 | 0,5 | 1,5 |
Вывод: кластеры выделены корректно, т.к. все внутрикластерные коэффициенты сходства превышают межкластерные.
Табл.1
Матрица исходных данных в оцифрованной (0/1) номинальной шкале
№ обрацза | Форма листовой пластинки | Форма основания листа | Окраска листа | Опушение листа снизу | Поражение морозами | Дата начала цветения | Диаметр венчика цветка | Окраска кожицы плода | Масса плода | Вкус плода | ||||||||||||||||||||||||||||
узк.яйц. | узк.ов. | узк.обр.яйц. | ов. | ов.яйц. | ов.обр.яйц. | шир.яйц. | шир.ов. | шир.обр.яйц. | округлая | окр.-конич. | коническая | зеленая | темно-зеленая | антоциановая | отсутствует | слаб. или ср. | сильное | 1 балл | 2-4 балла | 5 баллов | 29.04.-04.05. | 05.05.-10.05. | 11.05.-16.05. | 14-18 мм | 19-23 мм | 24-28 мм | зеленая | желтая | оранжевая | красная | 13-20 г | 21-28 г | 29-36 г | 37-44 г | 3,0-3,4 балла | 3,5-3,9 балла | 4,0-4,4 балла | |
Табл. 2
Коэффициенты сходства по Скелу и Сниту между 30 сеянцами алычи по комплексу 10 признаков
0,30 | 0,10 | 0,40 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,70 | 0,60 | 0,20 | 0,50 | 0,20 | 0,50 | 0,40 | 0.50 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,20 | 0,50 | 0,60 | 0,20 | 0,30 | 0,30 | ||
0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,60 | 0,30 | 0,40 | 0,20 | 0.10 | 0,30 | 0,00 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,30 | 0,20 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,20 | 0,20 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,50 | 0,10 | 0,40 | 0,50 | ||
0,10 | 0,30 | 0,20 | 0,10 | 0,10 | 0,20 | 0,20 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,10 | 0,10 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,20 | 0,20 | 0,20 | 0,10 | 0,20 | 0,10 | 0,30 | 0,40 | 0,20 | 0,20 | 0,20 | ||
0,40 | 0,30 | 0,20 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,70 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,60 | 0,60 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,20 | 0,60 | 0,60 | 0,40 | 0,60 | 0,30 | 0,60 | 0,70 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,20 | ||
0,50 | 0,60 | 0,10 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,40 | 0,20 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,60 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,60 | 0,40 | 0,50 | 0,60 | 0,10 | 0,40 | 0,70 | ||
0,40 | 0,30 | 0,10 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,20 | 0,60 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,40 | 0,70 | 0,60 | 5,00 | 0,20 | 0,40 | 0,20 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | ||
0,30 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,20 | 0,30 | 0,50 | 0,50 | 0,30 | 0,60 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,20 | 0,30 | 0,40 | 0,90 | 0,50 | ||
0,40 | 0,20 | 0,20 | 0,70 | 0,30 | 0,40 | 0,50 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,60 | 0,60 | 0,60 | 0,40 | 0,20 | 0,60 | 0,40 | 0,40 | 0,50 | 0,50 | 0,60 | 0,20 | 0,40 | 0,60 | 0,50 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | ||
0,50 | 0.10 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,20 | 0,50 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,50 | 0,20 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,40 | ||
0,40 | 0,30 | 0,20 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,20 | 0,20 | 0,30 | 0,20 | 0,50 | 0,20 | 0,60 | 0,60 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,40 | 0,60 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,10 | 0,30 | 0,50 | ||
0,30 | 0,00 | 0,40 | 0,40 | 0,20 | 0,30 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,10 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,50 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,20 | ||
0,40 | 0,40 | 0,20 | 0,20 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,20 | 0,20 | 0,50 | 0,40 | 0,20 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,20 | 0,30 | 0,60 | 0,50 | 0,50 | 0,30 | ||
0,30 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,20 | 0,60 | 0,50 | 0,20 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,60 | 0,60 | 0,50 | 0,20 | 0,40 | ||
0,70 | 0,30 | 0,10 | 0,60 | 0,40 | 0,20 | 0,30 | 0,60 | 0,30 | 0,30 | 0,10 | 0,20 | 0,30 | 0,50 | 0,20 | 0,20 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,50 | 0,20 | 0,20 | 0,20 | ||
0,60 | 0,50 | 0,10 | 0,60 | 0,60 | 0,60 | 0,50 | 0,60 | 0,30 | 0,20 | 0,30 | 0,50 | 0,50 | 0,50 | 0,20 | 0,50 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,60 | 0,60 | 0,50 | 0,50 | 0,30 | 0,70 | 0,50 | 0,50 | 0,50 | 0,30 | ||
0,20 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,20 | 0,20 | 0,10 | 0,60 | 0,40 | 0,40 | 0,50 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,60 | 0,40 | ||
0,50 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,20 | 0,40 | 0,20 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,20 | 0,50 | 0,10 | 0,20 | 0,20 | 0,60 | 0,30 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,20 | 0,30 | 0,20 | ||
0,20 | 0,20 | 0,40 | 0,50 | 0,30 | 0,30 | 0,60 | 0,60 | 0,30 | 0,60 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,60 | 0,20 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,60 | 0,50 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,50 | ||
0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,20 | 0,40 | 0,50 | 0,40 | 0,40 | 0,50 | 0,60 | 0,40 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,20 | 0,20 | 0,40 | 0,20 | 0,70 | 0,10 | 0,50 | 0,50 | 0,40 | 0,40 | 0,60 | ||
0,40 | 0,20 | 0,20 | 0,60 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,50 | 0,40 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,60 | 0,40 | 0,20 | 0,50 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,60 | 0,50 | 0,10 | 0,40 | 0,40 | 0,20 | ||
0.50 | 0,40 | 0,20 | 0,60 | 0,50 | 0,40 | 0,50 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,60 | 0,50 | 0,30 | 0,30 | 0,20 | 0,50 | 0,30 | 0,70 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,20 | ||
0,40 | 0,20 | 0,20 | 0,40 | 0,40 | 0,70 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,30 | 0,20 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,60 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,20 | 0,50 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | ||
0,30 | 0,20 | 0,10 | 0,60 | 0,30 | 0,60 | 0,30 | 0,60 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,50 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,20 | 0,50 | 0,70 | 0,50 | 0,20 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,20 | ||
0,50 | 0,50 | 0,20 | 0,30 | 0,60 | 5,00 | 0,40 | 0,20 | 0,50 | 0,60 | 0,30 | 0,30 | 0,20 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,40 | 0,40 | 0,70 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,20 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,20 | 0,40 | 0,50 | ||
0,20 | 0,30 | 0,10 | 0,60 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,40 | 0,20 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,60 | 0,10 | 0,60 | 0,30 | 0,20 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,20 | 0,30 | 0,30 | 0,40 | ||
0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,70 | 0,50 | 0,40 | 0,20 | 0,60 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,60 | 0,50 | 0,70 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,50 | 0,50 | 0,50 | 0,50 | 0,50 | 0,50 | 0,50 | 0,50 | 0,30 | 0,20 | 0,30 | ||
0,60 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,60 | 0,20 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,60 | 0,60 | 0,50 | 0,50 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,50 | 0,10 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,30 | 0,20 | 0,50 | 0,20 | 0,30 | 0,50 | ||
0,20 | 0,10 | 0,20 | 0,30 | 0,10 | 0,50 | 0,40 | 0,50 | 0,30 | 0,10 | 0,50 | 0,50 | 0,50 | 0,20 | 0,50 | 0,50 | 0,20 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,20 | 0,30 | 0,30 | 0,20 | 0,50 | 0,20 | ||
0,30 | 0,40 | 0,20 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,90 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,40 | 0,50 | 0,20 | 0,20 | 0,50 | 0,60 | 0,30 | 0,50 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,30 | 0,40 | 0,40 | 0,30 | 0,20 | 0,30 | 0,50 | 0,50 | ||
0,30 | 0,50 | 0,20 | 0,20 | 0,70 | 0,30 | 0,50 | 0,30 | 0,40 | 0,50 | 0,20 | 0,30 | 0,40 | 0,20 | 0,30 | 0,40 | 0,20 | 0,50 | 0,60 | 0,20 | 0,20 | 0,40 | 0,20 | 0,50 | 0,40 | 0,30 | 0,50 | 0,20 | 0,50 |
Табл. 3